Kaltwasser & Compañía, Ltda. Inició la distribución de productos Bayer en 1915. Bayer Guatemala fue fundada en 1962 para la fabricación y distribución de productos de Protección a Cultivos y Sanidad Animal.
En 1964, una segunda empresa - Bayer Farmacéutica Ltda. -- Fue fundada para la distribución de medicamentos con receta.
En Guatemala funcionan dos de las tres plantas de producción que operan en la región de Centroamérica y Caribe. La planta Bayer CropScience, dedicada a la formulación y envasado de productos fitosanitarios, principalmente insecticidas, funguicidas y herbicidas se encuentra en el municipio de Amatitlán.
En la planta situada en la ciudad de Guatemala se manufacturan productos de venta libre, primordialmente analgésicos, antigripales y medicamentos de la línea gastrointestinales.